Laboratory of Genomics

for Health and Longevity

News

  • 2024.03.31
  • 日本薬学会第144年会(横浜)において岡田典弘教授が演題「イントロン・リテンションをうつ病とそれを治療する漢方薬の評価に使う可能性について」を発表されました。
  • 2023.06.18
  • 第73回日本東洋医学会学術総会(福岡)のシンポジウムおいて岡田典弘教授が演題「未病の指標としてのイントロン・リテンション（IR)と漢方薬の可能性」を講演されました。その様子はこちら
  • 2023.04.13
  • 研究室が白金キャンパスに移転しました。
  • 2022.11.21
  • 邱銘姿 特任助教が着任しました。
  • 2021.12.22
  • Aging誌に北里大学東洋医学総合研究所との共同研究論文「Kampo formulas alleviate aging-related emotional disturbances and neuroinflammation in male senescence-accelerated mouse prone 8 mice」が受理されました。
  • 2020.11.24
  • BMC Supplementsに闘魚研究の論文「Alternative splicing plays key roles in response to stress across different stages of fighting in the fish Betta splendens」が受理されました。
  • 2020.09.14
  • Scientific Reports誌にヒトtDNAに関する論文が受理されました。
  • 2020.06.27
  • PLoS Genetics誌のWebサイトのTOPページに闘魚論文が掲載されました。
  • 2020.06.22
  • PLoS Genetics誌の闘魚論文が日本の研究.comのプレスリリースに掲載されました。
  • 2020.06.18
  • PLoS Genetics誌の闘魚論文がEurekAlertのNEWS RELEASEに掲載されました。
  • 2020.06.18
  • PLoS Genetics誌の闘魚論文がScienceのNewsに掲載されました。
  • 2020.06.11
  • ホームページを公開しました。
  • 2020.05.05
  • PLoS Genetics誌に闘魚研究論文が受理されました。
  • 2020.04.01
  • 薬学部寄附講座 健康長寿ゲノム講座が開設しました。

About

日本では世界のどの国もかつて経験をしたことの無いような超高齢化社会が進行しており、加齢によって生じる疾患を予防医学的に改善することは高齢者のQOLを高めることにつながるため極めて重要な課題です。漢方は高齢者医療においても使用されているが、西洋薬の単一成分とは違って複数の生薬を混合して用いられる超複合成分系であり、その効果を構成成分の視点から作用メカニズムを解明することは非常に困難です。そこで私たちの研究室では漢方薬が遺伝子レベルでどのように作用しているかをトランスクリプトーム、メチローム、プロテオーム、メタボローム、生化学的検査データなどを組み合わせたマルチオミクス手法を用いて老化状態における漢方の効果を検証する研究を進めています。

Member

  • 特任准教授
    Project Associate Professor
  • 大島 健志朗
    Kenshiro OSHIMA, Ph.D.
  • 特任准教授
    Project Associate Professor
  • 円子 顕子
    Akiko MARUKO, Ph.D.
  • 特任助教
    Project Assistant Professor
  • 邱 銘姿
    Ming-Tzu CHIU
  • 博士課程3年
    Graduate Student D3
  • 三木 理恵子
    Rieko MIKI
  • 秘書
    Secretary
  • 山田 恭子
    Kyoko YAMADA

Publication

    2024
  1. Okada N, Oshima K, Maruko A, Sekine M, Ito N, Wakasugi A, Mori E, Odaguchi H, Kobayashi Y.
    Intron retention as an excellent marker for diagnosing depression and for discovering new potential pathways for drug intervention
    Front Psychiatry (2024) 15:1450708. doi: 10.3389/fpsyt.2024.1450708 doi logo

    category : Japanese herbal medicine (Kampo)

  2. Okada N, Oshima K, Maruko A, Sekine M, Ito N, Wakasugi A, Mori E, Odaguchi H, Kobayashi Y.
    Intron retention can be an excellent marker for evaluating the depressed state and useful for discovering new pathways in the recovery of depression by a drug
    medRxiv (2024) 2024.03.30.24305001. doi: 10.1101/2024.03.30.24305001 doi logo

    category : Japanese herbal medicine (Kampo)

    2023
  1. Okada N, Oshima K, Maruko A, Vu TD, Chiu MT, Nishiyama M, Yamamoto M, Nishi A, Kobayashi Y.
    A potential pathway that links intron retention with the physiological recovery by a Japanese herbal medicine
    bioRxiv (2023) 2023.12.02.569734. doi: 10.1101/2023.12.02.569734 doi logo

    category : Japanese herbal medicine (Kampo)

  2. Mizukami K, Higashiyama H, Arima Y, Ando K, Okada N, Kose K, Yamada S, Takeuchi JK, Koshiba-Takeuchi K, Fukuhara S, Miyagawa-Tomita S, Kurihara H.
    Coronary artery established through amniote evolution
    eLife (2023) 12:e83005. doi: 10.7554/eLife.83005 doi logo PMID: 37605519 pubmed logo

    category : genomic evolution

    2022
  1. Nikaido M, Nishihara H, Okada N.
    SINEs as Credible Signs to Prove Common Ancestry in the Tree of Life: A Brief Review of Pioneering Case Studies in Retroposon Systematics
    Genes (2022) 13:989. doi: 10.3390/genes13060989 doi logo PMID: 35741751 pubmed logo

    category : genomic evolution

  2. Vu TD, Oshima K, Matsumura K, Iwasaki Y, Chiu MT, Nikaido M, Okada N.
    Alternative splicing plays key roles in response to stress across different stages of fighting in the fish Betta splendens
    BMC Genomics (2022) 22:920. doi: 10.1186/s12864-022-08609-2.doi logo PMID: 35637454 pubmed logo

    category : fighting fish

  3. Vu TD, Ito N, Oshima K, Maruko A, Nishi A, Mizoguchi K, Odaguchi H, Kobayashi Y, Okada N.
    Intron retention is a stress response in sensor genes and is restored by Japanese herbal medicines: A basis for future clinical applications
    Gene (2022) 830:146496. doi: 10.1016/j.gene.2022.146496 doi logo PMID: 35504437 pubmed logo

    category : Japanese herbal medicine (Kampo)

    2021
  1. Ito N, Maruko A, Oshima K, Homma K, Sugiyama C, Nagai T, Kobayashi Y, Odaguchi H, Okada N.
    Kampo formulas alleviate aging-related emotional disturbances and neuroinflammation in male senescence-accelerated mouse prone 8 mice
    Aging (2021) 14:109-142. doi: 10.18632/aging.203811 doi logo PMID: 34979499 pubmed logo

    category : Japanese herbal medicine (Kampo)

  2. Vu TD, Iwasaki Y, Oshima K, Chiu MT, Nikaido M, Okada N.
    Data of RNA-seq transcriptomes in the brain associated with aggression in males of the fish Betta splendens.
    Data in Brief (2021) 38:107448. doi: 10.1016/j.dib.2021.107448 doi logo PMID: 34660862 pubmed logo

    category : fighting fish

  3. Okada N, Oshima K, Iwasaki Y, Maruko A, Matsumura K, Iioka E, Vu TD, Fujitsuka N, Nishi A, Sugiyama A, Nishiyama M, Kaneko A, Mizoguchi K, Yamamoto M, Nishimura S.
    Intron retention as a new pre-symptomatic marker of aging and its recovery to the normal state by a traditional Japanese multi-herbal medicine
    Gene (2021) 794:145752. doi: 10.1016/j.gene.2021.145752 doi logo PMID: 34082065 pubmed logo

    category : Japanese herbal medicine (Kampo)

  4. Nakamura H, Aibara M, Kajitani R, Mrosso HDJ, Mzighani SI, Toyoda A, Itoh T, Okada N, Nikaido M.
    Genomic Signatures for Species-Specific Adaptation in Lake Victoria Cichlids Derived from Large-Scale Standing Genetic Variation.
    Mol. Biol. Evol. (2021) msab084. doi: 10.1093/molbev/msab084 doi logo PMID: 33744961 pubmed logo

    category : genomic evolution

  5. Vu TD, Iwasaki Y, Oshima K, Chiu MT, Nikaido M, Okada N.
    A unique neurogenomic state emerges after aggressive confrontations in males of the fish Betta splendens.
    Gene (2021) 784:145601. doi: 10.1016/j.gene.2021.145601 doi logo PMID: 33766705 pubmed logo

    category : fighting fish

    2020
  1. Okada N, Oshima K, Iwasaki Y, Maruko A, Matsumura K, Iioka E, Vu TD, Fujitsuka N, Nishi A, Sugiyama A, Nishiyama M, Kaneko A, Mizoguchi K, Yamamoto M, Nishimura S.
    Intron retention as a new pre-symptomatic marker of aging and its recovery to the normal state by a traditional Japanese multi-herbal medicine.
    bioRxiv (2020) 2020.02.10.941435. doi: 10.1101/2020.02.10.941435 doi logo

    category : Japanese herbal medicine (Kampo)

  2. Iwasaki Y, Ikemura T, Kurokawa K, Okada N.
    Implication of a new function of human tDNAs in chromatin organization.
    Sci. Rep. (2020) 10:17440. doi: 10.1038/s41598-020-74499-7 doi logo PMID: 33060757 pubmed logo

    category : genomic evolution

  3. Vu TD, Iwasaki Y, Oshima K, Nikaido M, Chiu MT, Okada N.
    A unique neurogenomic state emerges after aggressive confrontations in males of the fish Betta splendens.
    bioRxiv (2020) 2020.08.05.237586. doi: 10.1101/2020.08.05.237586 doi logo

    category : fighting fish

  4. Vu TD, Iwasaki Y, Shigenobu S, Maruko A, Oshima K, Iioka E, Huang CL, Abe T, Tamaki S, Lin YW, Chen CK, Lu MY, Hojo M, Wang HV, Tzeng SF, Huang HJ, Kanai A, Gojobori T, Chiang TY, Sun HS, Li WH, Okada N.
    Behavioral and brain-transcriptomic synchronization between the two opponents of a fighting pair of the fish Betta splendens.
    PLoS Genet. (2020) 16:e1008831. doi: 10.1371/journal.pgen.1008831 doi logo PMID: 32555673 pubmed logo

    category : fighting fish

Access

  • 〒108-8641

    東京都港区白金5-9-1

    北里大学 薬学部 健康長寿ゲノム講座

    03-5791-6445 (直通)

    Laboratory of genomics for health and longevity, School of Pharmacy, Kitasato University

    5-9-1 Shirokane, Minato-ku, Tokyo 108-8641, Japan

    +81-3-5791-6445 (direct)

Source : Screenshot of PLoS Genetics website (Jun/25/2020)
URL : https://journals.plos.org/plosgenetics/

朝日新聞朝刊(2020/07/30付,科学面)に掲載。
朝日新聞社に無断で転載することを禁じる。

二次利用（複製・転載等）承諾番号「20-2846」

第73回日本東洋医学会学術総会(福岡)